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    01 什么是GEO数据库 GEO（GENE EXPRESSION OMNIBUS）数据库 是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）于2000 年创建的基因表达数据库，收录了世界各国研究机构提交的基因表达数据，主要包括 肿瘤、非肿瘤、芯片、NGS、差异分析、分子验证等各种公开数据。
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    一、GEO 数据库简介与数据结构 GEO（Gene Expression Omnibus）是由美国国家生物技术信息中心（NCBI）维护的公共功能基因组数据存储库，主要存储基因表达、芯片数据、RNA-seq 数据及其他高通量测序数据。根据 NCBI 官方介绍（NCBI, 2023），GEO 已收录数百万样本数据，广泛用于医学、生物学与转化研究。 在
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    GEO，全称Gene Expression Omnibus，由美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBD）于2000年创建并维护至今。 初始建立的时候，主要存储表达芯片数据，之后逐渐扩展到许多其它数据类型，比如二代测序以及其他形式的高通量基因组数据，并提供免费下载。 现在的GEO不仅包括原始数据、处理后的数据，与样本资料等，还慢慢增加了可视化和数据分析的功能，例如经典的GEO2R。 很多涉及高通量测序的文章发表时会将原始数据上传至GEO数据库并在文章中提供GSE号，如果想对某些文章的数据进行再分析，可以在GEO数据库搜索文章中的GSE号。





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