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  • “虚拟敲除”、“虚拟扰动”联合单细胞直接发一区——更多 . . .
    还有 scFOCAL [4]计算框架，这提供了一个强大的“计算机扰动”平台， 可以在实际给药前模拟治疗效果，加速药物重定位和联合治疗策略的开发。 这也说明 “虚拟细胞” 不再是幻灯片里的示意图，而是实验设计前不可或缺的“预演屏”，更多重磅应用
  • 全球首届 AI 虚拟细胞大赛结果出炉，华人科学家横扫全场
    通过在计算机中模拟药物对细胞的扰动效应 ，该模型能帮助科研人员以更低的成本、更高的效率，从海量候选分子中筛选出最具潜力的新药，并提前预测其疗效与副作用，从而显著提升临床试验的成功率。 该团队创新性地融合了深度…
  • 训练自2. 67亿个单细胞数据的AI虚拟细胞模型——STATE . . .
    近日，Arc 研究所发布了其第一代虚拟细胞模型——STATE，该虚拟细胞模型旨在预测各类干细胞、癌细胞和免疫细胞对药物、细胞因子或基因扰动的反应。 STATE 模型基于 1 67 亿个细胞的观察数据以及超过 1 亿个细胞的扰动数据进行训练，这些数据涵盖了 70 种细胞系。 该论文已于近期发表在了预印本平台 bioRxiv 上。 STATE 的使用很简单：给定一个初始转录组和一个干扰因素，STATE 就能预测 RNA 表达的变化。 STATE 由两个相互关联的模块组成——State Embedding（SE）模型和 State Transition（ST）模型。
  • Arc Institute提出首个AIVC虚拟细胞模型STATE - CSDN博客
    为了解决这些挑战并推动虚拟细胞模型的发展，2025年6月24日Arc Institute联合斯坦福、UCSF等顶尖机构发布了其第一代虚拟细胞模型STATE，这是一种灵活且富有表达力的机器学习架构，用于建模细胞异质性和跨不同数据集的扰动效应。
  • 虚拟细胞原理简介-腾讯云开发者社区-腾讯云
    虚拟细胞技术通过单细胞数据模拟基因变化，利用扩散模型生成高保真转录组数据。 可预测细胞分化轨迹、基因扰动效应及药物反应，为生物研究提供新思路。 Squidiff等软件实现虚拟扰动计算，助力科研探索。
  • VCWorld：虚拟细胞模拟的生物世界模型 | alphaXiv
    VCWorld是一种虚拟细胞模型，它利用知识图谱和大型语言模型推理来预测基因表达对药物扰动的响应。它在新的GeneTAK基准测试中取得了卓越性能，在差异表达任务中准确率超过0 70，在方向性变化任务中准确率达到0 65-0 72，同时提供了透明且生物学一致的机制解释。
  • 斯坦福Arc Tahoe-100M虚拟细胞团队专访：AI制药的壁垒不是 . . .
    Vevo Therapeutics（现为Tahoe）与Arc研究所，两家分别在生物技术商业转化和非营利性基础研究领域领先的机构，于2025年2月联合发布了一项里程碑式的成果：全球最大的单细胞药物扰动数据集Tahoe-100M。
  • Nat Methods | 刘琦团队开发单细胞扰动响应全面基准评估 . . .
    同时，平台提出的基于解耦学习的 cell line embedding 策略，为提升模型在新细胞背景下的泛化能力提供了可行路径。 该工作有望为未来单细胞扰动响应预测模型的算法设计与选择等应用提供重要参考。
  • 使用 State 预测不同情境下的细胞扰动响应 | 教程 | HyperAI . . .
    STATE 是由非盈利研究机构 Arc Institute 联合 UC 伯克利、斯坦福等高校的研究团队，推出的虚拟细胞模型。 能够预测干细胞、癌细胞和免疫细胞在药物、细胞因子或遗传干预下的响应情况。 其训练数据涵盖了来自近 1 7 亿个细胞的观察性数据，以及超过 1 亿个细胞的干预性数据，涉及 70 种不同细胞系，并整合了 Arc 虚拟细胞图谱（Virtual Cell Atlas）中的数据。 实验结果显示，State 在预测干预后转录组变化的表现显著优于当前主流方法。 在 Tahoe-100M 数据集的测试中，其在区分干预效果方面提升了 50%，在识别差异表达基因方面的准确率是现有模型的 2 倍。
  • 10亿美元加持！诺奖天团祭出全球最大AI虚拟细胞，性能5倍 . . .
    该数据集涵盖 2560 万个扰动单细胞转录组，涵盖 15 2 万 + 独特的扰动 - 环境组合，分布在七个生物多样性的细胞环境中，规模是 Xaira 之前数据集X-Atlas Orion 的三倍多。 于是基于X-Atlas Pisces， Xaira训练了 虚拟细胞 X-Cell。





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